对SARS-CoV-2 基因组数据持续监测,分析病毒突变趋势,对预测疫情走向,采取及时相应措施非常重要。在病毒不断的突变过程中,会出现毒力、传染性和/逃避疫苗等特征的变化。2021年8月13日安省公共卫生署(Public Health Ontario)公布了6月27日到7月24新冠病毒全基因测序(whole genome sequencing , WGS) 的数据。全基因测序总病例为2750人,占同期全部报告病例的57%。
以下是该报告部分内容简介:
- 报告研究期间,德尔塔(Delta,B.1.617.2) 新冠病毒比例大幅升高,四周平均占全部病毒变种的81.7%。
- 阿尔法(Alpha B.1.1.7, 最早在英国流行的病毒变种) 占13.2%,而P.1 (Gamma) 和 B.1.621 (世界卫生组织尚未正式命名) 分别占 2.2%和1.2%。
- 这期间只监测到一例拉姆达(Lambda, C37),安省自2021年1月以来共监测到7例染拉姆达变种的病例,<1%。
- 如果以7月18-24日的数据计算,德尔塔病毒变种占89.4%,根据作者推算安省目前该新冠变种应该已超过95%。
- 另外值得一提的是:在四周内B.1.621新冠病毒变种从0.5%增加的1.2%,增加幅度之大令人关注。 美国CDC最新数据,B.1.621占2%,而且还在上升。来自欧洲的一项研究报告提示,“B.1.621 显然有可能在接种疫苗的老年患者中致命,并且也有可能变得更容易传播”。尽管目前世界卫生组织还没有正式命名这个新冠变种,会是未来北美关注的重要新冠变种。
下表是安省公布的完整病毒变种数据,全部监测到的变种为16种。
目前加拿大把这些病毒变种分为:关注变种 (Variant of Concern, VOC), 和感兴趣变种(Variant of Interest, VOI) ,这与世界卫生组及美国CDC的分类是一致的。
过去3个月以来,德尔塔新冠病毒变种的比例一直快速上升,从5月初的约7%上升到90% (下图橙色部分),估计目前已超过95%。安省若干地区的德尔塔变种比例已达100%,比如滑铁卢地区,杜兰地区等。
而阿尔法病毒变种的相对比例从80%降到5.7%(上图蓝色部分)。
主要资料来源:
1. A New Covid Variant On The Loose: B.1.621, https://www.forbes.com/sites/williamhaseltine/2021/08/12/a-new-killer-on-the-loose-b1621/?sh=22da29603d1f
2. Alpha, Beta, Delta, Gamma: What’s important to know about SARS-CoV-2 variants of concern? https://cmajnews.com/2021/06/18/covid-variants-1095949/
3. COVID-19 Data and Surveillance, https://www.publichealthontario.ca/en/data-and-analysis/infectious-disease/covid-19-data-surveillance
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《北美华人健康》2021年卷第2期. Volume 2021, Number 4.